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基因测序及分析

  随着生命科学的不断发展,基因测序已经成为当今科研和诊断领域不可或缺的重要工具。在遗传疾病诊断、病原体检测、个性化医疗等领域,测序需求的持续井喷,也推动着测序手段本身的不断前进。继第一代测序技术后,二代测序(也称为高通量测序)在本世纪初应运而生,标志着测序手段的又一次革命性突破。二代测序技术一经问世,就以其通量大、速度快等远超传统的测序技术的特点,成为生命科学的各个应用领域的主角。


高通量测序种类

  根据测序目标核酸来源和状态的不同的,可分DNA水平、RNA水平、转录水平三大类型。

测序后分析种类

  高通量的二代测序结果是海量的数据,仅仅得到这些数据是不够的,要让测序数据能“说话”,就要通过后续的一系列分析挖掘其中蕴藏的信息。测序后的数据分析按照其本身的流程特点,可以分为OTU分析、DGE分析、功能富集分析、基因-样本聚类、KEGG、GO等等常规的分析,分析人员也可以按照客户需要提供更多个性化分析服务。



分析效率的关键——计算平台


  熟悉分析的手段和种类,并不一定就能马上动手处理数据。因为就一般用户来说,用计算机处理庞大的测序数据,仍然是一件十分消耗计算和存储能力的事情,普通PC机难以胜任。为此,许多企业和机构纷纷选择动用专门HPC或搭建计算机集群的方式解决。高性能计算应用平台则更进一步,运用了基于计算机集群技术和云技术搭建的高性能的数据分析云平台,融合了高效的传输压缩算法和先进的FANSe2比对算法,为耗时的数据分析过程提供强劲的动力。不仅降低数据分析成本,更能大幅节省宝贵的时间。


分析准确的关键——算法

  分析过程中算法的选择是十分关键的,因为只有了解到每种算法或软件的特性,才能正确运用并取得准确的分析结果。以RNA-Seq分析必须的mapping类型算法为例,目前已知的数十种算法各有优缺点,让人无所适从。我们推荐的FANSe2算法是一种先进的高精度核酸(蛋白)匹配算法,它创造性地运用弹性seed和其他先进的算法思想,实现了既快速又准确地序列比对。FANSe2能最大限度地做到精确匹配,因此计算结果更加接近真实,大幅降低假阳性率,分析结论可验证性强。。

分析成败的保证——实力

  凭借科研服务领域持续的投入和耕耘,我们服务平台已经成长为华南地区有广泛影响力的科研服务品牌。经过在生物信息领域长久的积累,我们不仅拥有专业的技术人才队伍,更获得众多专家的倾力支持。我们将以我们的经验和优势,为您带来更加专业的服务。

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