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药物信息学

基于配体-靶标网络的抗2型糖尿病药物设计

2型糖尿病(T2D)是系统性代谢疾病。因发病机制复杂,目前临床使用的抗T2D药物疗效不理想。发现新的抗T2D药物仍然是研究热点。我们新建立了基于配体-靶标网络分析方法.......

基于配体的药物筛选平台(LBVS)

组合化学的发展和高通量筛选技术的发展积累了大量的小分子与靶标相互作用的活性数据。与日俱增的化合物-靶标活性数据为基于配体的虚拟筛选创造了机遇.......

靶标依赖的分子相似度算法以及在虚拟筛选中应用

化学基因组学(Chemogenomics)的发展积累了大量小分子和大分子之间相互作用的数据,也推动了开源数据库如PubChem,ChEMBL, Zinc,BindingDB等的发展,合理挖掘利用这些大数据,可以提高虚拟筛选命中率,加速药物发现。化学相似度计算是基于配体的虚拟筛选重要方法。 传统相似度计算利用分子指纹的方法,默认每个指纹的权重是同等重要的。靶标依赖的分子相似度算法(TDMS: Target Dependent Molecular Similarity)利用自主开发的化学信息学平台,对ChEMB.......

活性标注的化合物骨架数据库(ASDB)

新颖化学骨架的活性先导化合物是药物化学的重要任务。因此,化合物骨架的概念在药物化学和化学信息学中引起关注。一个药物靶标一般有多个化合物骨架的配体,一个化学骨架也可能同时作用于多个药物靶标.......

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