欢迎光临广州生物与健康产业高性能计算应用平台! 常用工具 | 下载中心 | 登录 | 注册 | 关于我们 | 联系我们

当前位置: 首页>>

活性标注的化合物骨架数据库(ASDB)

  发现具有新颖化学骨架的活性先导化合物是药物化学的重要任务。因此,化合物骨架的概念在药物化学和化学信息学中引起关注。一个药物靶标一般有多个化合物骨架的配体,一个化学骨架也可能同时作用于多个药物靶标,这就形成了骨架-靶标之间多对多的网络关系。构建骨架与靶标之间的网络关系数据库,并围绕每一个化合物骨架进行丰富的活性标注,包括基本结构ID信息,物理化学性质、相关的药物、天然产物、药物靶标等信息。我们利用ChEMBL数据库,提取化合物骨架的结构信息以及靶标信息,同时对每个骨架建立唯一的骨架ID,并将骨架ID链接药物数据库DrugBank, 天然产物数据库TCMSP, 蛋白靶标数据库UniProt。同时,ASDB提供系列检索工具,包括全结构,子结构检索,相似度检索(2D/3D),以及文本检索。同时ASDB提供在线构建骨架-靶标网络服务,可以基于用户提供的骨架或者靶标,构建骨架与靶标之间的关系。这为多靶标的药物设计提供思路。

CopyRight &copy 2015 广州生物工程中心   All Rights Reserved.

粤ICP备12345678号-3

0.0270s